海洋環境アセスメントのための微生物実験法

総　　論
1 章　微生物学的側面からの海洋環境のアセスメント（石田祐三郎）

基　礎　編
2 章　海洋の試料の採取法と化学物質の測定法
1 節　海水および底泥採取法
§1．海水のサンプリング法（深見公雄）
§2．底泥のサンプリング法（石田祐三郎）
§3．プランクトン採取法（今井一郎）
　
2 節　海洋の化学物質の測定法
§1．塩分（Salinity）（深見公雄）
§2．溶存酸素（DO：Dissolved Oxygen）（深見公雄）
§3．アルカリ度（Alkalinity）（深見公雄）
§4． pH （深見公雄）
§5．懸濁物重量（SS：Suspended Solids）（深見公雄）
§6．海水中の懸濁態と溶存態の分離法（菅原　庸）
§7．アンモニア態窒素（菅原　庸）
§8．亜硝酸態窒素（菅原　庸）
§9．硝酸態窒素（菅原　庸）
§10．全窒素（菅原　庸）
§11．リン酸態リン（近藤竜二）
§12．全リン（近藤竜二）
§13．硫化物（底泥）（近藤竜二）
§14．水中の植物色素（クロロフィル）（江口　充）
§15．水と泥の化学的酸素消費量（COD：Chemical Oxygen Demand）（江口　充）
§16．生物化学的酸素消費量（BOD）（江口　充）
§17．全有機態炭素量（TOC）（江口　充）
§18．n-ヘキサン抽出物（石油を含む）（川合真一郎）
§19．重金属（山本義和）

3 章　海洋汚染指標としての基準微生物測定法
1 節　微生物実験の基本操作法
§1．微生物実験の特徴と注意（藤井建夫）
§2．培地の調製（杉田治男）
§3．微生物の計数法（杉田治男）
§4．細菌の同定（杉田治男）
§5．微生物の形態学的性質（藤井建夫）
§6．微生物の生理学的性質（藤井建夫）
　
2 節　環境微生物計数・分離法
§1．大腸菌群の計数・分離法と培地（木村　凡・藤井建夫）
§2．直接計数法（吉永郁生・前田俊道）
§3．赤潮微細藻類の計数と無菌培養法（今井一郎）

応　用　編
4 章　各種環境微生物の測定法
1 節　環境微生物の計数・分解法
§1．硝化細菌（西尾孝之）
§2．脱窒細菌（西尾孝之）
§3．硫酸還元細菌（前田広人）
§4．高分子分解細菌（坂田泰造・吉川　毅）
§5．好熱細菌（坂田泰造・吉川　毅）
§6．好冷細菌（坂田泰造・吉川　毅）
§7．嫌気性菌（坂田泰造・吉川　毅）
§8．光合成細菌（坂田泰造・吉川　毅）
§9．バクテリオファージ（坂田泰造・吉川　毅）
§10．難分解性細菌（川合真一郎）
§11．好圧細菌の計数・分離法（中山昭彦）
§12．nonculturable bacteria 計数法（吉永郁生）
§13．赤潮・貝毒プランクトンのシストの計数（山口峰生・今井一郎）
§14．従属栄養性微小鞭毛虫の識別と計数法（今井一郎・深見公雄）
§15．海洋細菌の抗菌活性の測定（杉田治男）
§16．アオコ形成ラン藻の計数と同定（吉田天士・広石伸互）

2 節　環境微生物の分子識別法（1）細菌
§1．海洋細菌のゲノム DNA の抽出
　　（吉永郁生・内田　有恆・片野坂徳章・芝　恒男）
§2．16S rRNA 遺伝子（16S rDNA）の PCR 増幅
　　（吉永郁生・内田　有恆・片野坂徳章・芝　恒男）
§3．16S rRNA 遺伝子の塩基配列決定
　　（吉永郁生・片野坂徳章・芝　恒男）
§4．16SrDNA-RFLP法（吉永郁生・片野坂徳章・芝　恒男）
§5．16S rDNA 塩基配列情報に基づく分子系統解析
　　（吉永郁生・片野坂徳章・芝　恒男）
§6．DNA/DNA ハイブリダイゼーション（近藤竜二）
§7．LAMP 法による迅速・正確な遺伝子の検出方法（江口　充）
§8．コロニー PCR 法による細菌16SrRNA遺伝子の増幅（北口博隆）
　
3 節　環境微生物の分子識別法（2）赤潮有毒微細藻類
§1．モノクローナル抗体法（足立真佐雄・広石伸互）
§2．rRNA 遺伝子による系統解析（左子芳彦）
§3．蛍光 in situ ハイブリダイゼーション法による分子識別（左子芳彦）

5 章　環境汚染物質と微生物の活性の測定法
1 節　難分解性化合物の分析法
§1．内分泌攪乱物質のin vitroスクリーニング法（川合真一郎）
§2．難分解性物質の分解活性試験法（川合真一郎）
　
2 節　赤潮藻の増殖潜在力測定法 179
§1．AGP 試験（藻類増殖潜在力試験）（西島敏隆） 179
　
3 節　微生物の生産測定法
§1．有機物分解活性（菅原　庸）
§2．光合成活性（一次生産）（深見公雄）

6 章　環境修復技術（バイオレメディエーション）
1 節　赤潮殺藻微生物計数法
§1．殺藻細菌と殺藻真核微生物（満谷　淳・坂田泰造）
§2．微細藻類ウイルス（長崎慶三）
索　引